AS Merko Ehituse juhatuse esimees on alates 1. jaanuarist 2012 Andres Trink. AS Merko Ehituse juhatuses jätkavad Viktor Mõisja ja Alar Lagus. Ettevõtte nõukogus muudatusi ei toimunud.
AS Merko Ehituse endine juhatuse esimees Tiit Roben siirdub juhtima vastloodud äriühingut AS Merko Ehitus Eesti. Uue äriühingu juhatusse kuuluvad veel Jaan Mäe, Andres Agukas, Alar Lagus ja Veljo Viitmann. Ettevõtte nõukogusse kuuluvad Andres Trink, Tõnu Toomik, Teet Rooplau ja Taavi Ojala.
2. detsembril 2011 otsustas AS Merko Ehitus muuta grupi juhtimisstruktuuri. Selle tulemusena loodi uus äriühing AS Merko Ehitus Eesti, kuhu koondatakse kogu Eestis toimuv ehitustegevus. AS Merko Ehitus jätkab edasi valdusettevõttena, kes iseseisvalt tootmistegevusega ei tegele.